Risen diễn ra tại Faranga, một núi lửa hư cấu, nằm ở một hòn đảo Địa Trung Hải với các tiểu vùng khí hậu khác nhau và khu thực vật. Hòn đảo này là nơi sinh sống của con người, cũng như nhiều sinh vật kỳ quái khác.

Gần đây tại Faranga, đã xảy ra sự kiện di tích những ngôi đền cổ trồi lên từ dưới hòn đảo nổi lên từ mặt đất, cung cấp truy cập một mạng lưới kết nối các khu vực ngầm dưới đất như hầm mộ và ngục tối. Kết quả là, con người đã biến nơi này thành một Toà án dị giáo, cấm bất cứ ai ra khỏi thành phố hoặc đảo[5]

Trong đoạn phim giới thiệu một nhân vật chính vô danh, và một phụ nữ gypsy tên Sara đã lén trốn trên một chiếc tàu nhỏ ở giữa vùng biển bão tố. Khi họ ở trên sàn tàu, họ nhìn thấy Inquisitor (Quan tòa án dị giáo), triệu hồi một con Titan ở vùng biển. Các Titan khổng lồ nổi lên giữa sóng nước, gào thét vào Inquisitor. Inquisitor cố gắng chiến đấu với sinh vật này, nhưng hắn nhận ra rằng cuộc chiến thất bại và ngay lập tức dịch chuyển khỏi tàu. Vài giây sau các Titan đập vỡ thuyền thành từng mảnh nhỏ, gửi Sara và nhân vật chính không tên ra giữa biển sâu. Nhân vật người chơi tỉnh dậy trên bờ Faranga ở giữa cơn bão, bao quanh bởi các xác chết. Cả anh và Sara đều không bị thương.

Sau khi khám phá hòn đảo và gặp những người khác, người chơi có thể lựa chọn một trong ba phe (faction) trong trò chơi bao gồm Don Esteban (một nhóm cướp mà trước đó đã kiểm soát hòn đảo cho đến khi Toà án dị giáo trục xuất chúng ra khỏi thị trấn), Toà án dị giáo (một nhóm các chiến binh được lệnh đến hòn đảo để khám phá những bí ẩn của những tàn tích nổi lên), hoặc các Pháp sư (những người bảo vệ nguyên thủy của hòn đảo, bây giờ được Toà án dị giáo chỉ huy). Ngay sau đó, người chơi bị dính líu với kế hoạch của một Inquisitor cấp cao là Mendoza, người đã phát hiện một ngôi đền dẫn vào trung tâm của núi lửa. Ông dự định sẽ đột nhập vào nó, nhưng lại cần đến sự trợ giúp của nhân vật chính trong việc tìm kiếm năm Đĩa Pha Lê, có chức năng như là chìa khóa cho ngôi đền.

Một khi người chơi đã thu thập được năm Đĩa Pha Lê, vốn rải rác trên đảo, Toà án dị giáo đi vào Nhà tù Núi lửa (Volcano Keep). Tại đây họ phát hiện ra rằng một Titan huyền thoại, cùng với Chúa Titan Ursegor (vua Thằn Lằn đồng thời là người tìm cách kiểm soát sức mạnh của gã Titan huyền thoại đó), đang bị cầm tù. Nó còn tiết lộ rằng sở dĩ Faranga được cơn bão bảo vệ là vì sự có mặt của Titan, trong khi lục địa đã bị tàn phá bởi những Titans khác, những Titans này được giải thoát khi các vị thần bị con người trục xuất. Inquisitor Mendoza tìm cách giành quyền kiểm soát của Titan Lửa bên trong núi lửa để đánh bại các Titans khác. Trong việc loại bỏ các Titan từ nhà tù, Faranga rất dễ bị những cơn bão tố thần bí tàn phá và thực sự phải hy sinh vì lợi ích của loài người.

Sau khi phóng thích Ursegor từ lời nguyền buộc linh hồn hắn vào xác chết của hắn trong Volcano Keep, người chơi sẽ phải tìm kiếm những mảnh áo giáp Titan Lord's, để anh ta có thể đi vào nơi Titan Lửa và đánh bại Mendoza. Những mảnh áo giáp đã được niêm phong trong các di tích với một số linh mục cương thi. Người chơi khám phá di tích nổi lên, lấy áo giáp, và đi vào Volcano Keep đằng sau Mendoza. Mendoza trở nên điên loạn và bị người chơi đánh bại. Sau đó, người chơi sẽ trục xuất các Titan Lửa sau khi đánh bại hắn trong trận đấu.

Kết thúc sau cùng cho rằng Faranga đã được tha thứ và thoát khỏi sự hủy diệt, nhưng bốn Titans còn lại tiếp tục tàn phá đại lục. Sau đoạn kết thúc, xuất hiện một cuộc đối thoại giữa nhân vật chính và Patty, con gái của một tên cướp biển khét tiếng, ám chỉ cả hai sẽ đi vào lục địa để chống lại các Titan trong phần tiếp theo.